青岛一组 7月2号 实习

老师以生动易懂的方式，带我们穿越测序技术的时光长廊，梳理从一代到三代测序技术的迭代历程。同时，他还会结合准确度、测序长度、测序成本等关键指标，深入剖析三代测序技术间的差异与内在联系，让复杂的技术原理变得清晰明了。

带我们回顾了测序技术从初代到二代的发展历程，深入讲解二代建库测序原理，还传授了二代测序文章的构建方法，把复杂知识讲得通俗易懂 。

本次讲解的重点围绕着依据测序仪原理构建文库的全流程展开。汤老师详细讲解了样本制备、文库创建、上机测序及数据分析等环节，着重强调文库制备是决定测序实验成败的关键。在展示百灵自动化实验过程时，老师也进行了细致入微的讲解，不仅拓宽了大家的视野，也激发了我们对测序技术深入学习的热情。

汤老师以PPT为辅助，系统讲解了Illumina这一主流测序平台的双桥法扩增与二代测序原理，将复杂的技术细节清晰呈现。同时，他还介绍了华大测序平台，其利用滚动复制技术，能够有效避免错误积累，展现出独特的技术优势，让大家对不同测序技术的特点有了更深入的认识。

后由赵老师为我们带来三代测序技术原理及应用，开篇讲解了三代测序技术的发展历史以及三代与一二代技术的区别

PacBio的测序原理在于光信号识别，四种碱基会释放出不同颜色的光信号，仪器通过捕捉这些信号，就能准确翻译出碱基序列。其特点为有壁可以排除光信号的干扰，其专利可以为其到来800万至2500万的测序长度。

紧接着，讲解深入到PacBio建库环节。老师细致拆解了整个流程，点明每个关键点背后的门道：比如加接头形成哑铃形文库，则是为DNA片段装上“定位器”，确保它们在测序时能精准“停靠”，为后续超长读长的准确测定打好基础。

随后，讲解聚焦于转录与MCD的构建技术，老师详细剖析了扩增产物的结构特征与串联方式。

ONT采用电信号识别技术。它利用极小的纳米孔，每次仅允许一条单链DNA或RNA通过。当马达蛋白驱动核酸链穿过纳米孔时，不同碱基通过纳米孔产生的电信号强度各异，ONT正是通过捕捉这些独特的电信号变化，精准“翻译”出碱基序列，以这种精巧的设计实现单分子水平的测序。

老师先用一段生动有趣的视频当“钥匙”，轻轻推开DNA与RNA的知识大门，瞬间抓住了大家的眼球。紧接着，他凭借扎实的专业知识，带我们认识了DNA和RNA的不同类型，细致讲解了它们各自的特点、功能与分布区域。原本抽象复杂的分子知识，在老师的解读下变得清晰易懂，让我们对这两种生命关键分子有了基础且深刻的认知。

史老师用简洁生动的话为我们讲解了DNA，RNA提取流程与原理，其中包括裂解法，沉淀法（重点讲解了沉淀剂的优缺点），磁珠法。形象的介绍了提取出的DNA最理想的状态，以及出现不同形态时的原因以及解决方案。

后为我们讲解了RNA检测的不同方面检测值与原理，DNA和RNA提取中的问题，例如蛋白质，多糖，多酚，盐离子的去除，DNA的降解，RNA完整性不能满足下游需求。

在下午，高昊阳老师给我们讲生物信息在工作中做什么。

老师为同学们系统讲授了不同代际测序技术知识：简要介绍一代测序技术；深入阐释二代测序技术，涵盖其高通量实现原理、读长短的成因，并详细解析fastaq存储格式（包括ID、序列、质量值）及打分机制；着重讲解三代测序原理，强调芯片上零模波导孔数量与通量的正相关关系，指出当前技术已能满足日常研究需求，同时剖析了PB技术的优势与局限。此外，还提及CLR和CCS虽原理相通，但模式存在差异 。

上午老师围绕测序技术进行系统讲解，在提及文库构建的基础上，着重剖析了CLR和CCS的异同——CCS虽片段较短但准确度高，CLR则准确度低需借助二代测序序列比对纠错，同时阐述了CCS的纠错原理；讲解了Nanopore测序依靠碱基电位差形成电流捕获序列，虽准确性低却拥有超长读长的技术特点；最后点明T2T端粒到端粒测序是在染色体水平上进行的测试。

老师深入讲解了Denove相关知识与基因组学内容：介绍Denove的概念，阐述基因组学领域的主要工作，包括基因组组装、注释以及个性化分析；详细解读bases（碱基）、reads（测序读长）、contig、scaffold的概念，并剖析它们之间的内在联系；同时，还细致地为大家解答了kmer峰的计算方法及其峰值所蕴含的生物学意义 。

老师讲解基因家族及基因组研究内容：介绍基因家族关系，讲解进化树、分化时间、扩张收缩、选择压力分析方法；阐述全基因组复制事件检测指标（Ks和4DTV），以及基因组共线性分析。

最后，老师带领我们系统梳理并巩固复习了Linux的基础操作要点，同时就所需掌握的语言水平标准进行了详细讲解。此外，老师还贴心地为我们分享了获取相关学习资料的多种渠道 ，助力我们后续的深入学习。